Details
Fin
Le jeu possède 3 fins différentes, 1 alternative et 2 variantes.
Fin alternative
Il s'agit d'une fin secrète se trouvant au début du jeu, comme pour Far Cry 4 (considéré d’ailleurs comme une référence à ce dernier). Lorsque le Marshal demande au joueur de menotter Joseph, le joueur n'a qu'a attendre et ne rien faire dans une ambiance pesante, puis, a un certain moment le Shérif décidera que le groupe s'en aille sous l’incompréhension du Marshall qui menace de le faire arrêter lui et le joueur, avant de sortir de l'église dans laquelle ils se trouvent. Il est à noter que Joseph prononce les mêmes phrases que dans son discours avant de faire le choix de résister ou de s'en aller à la fin du jeu si le joueur a fait la campagne.
Fin : résister (fin nucléaire)
Après avoir libéré les 3 régions et tué les 3 membres de la famille de Joseph, le joueur se rend sur l’île de ce dernier, qui est le lieu du début du jeu, et fait face à Joseph. Ce dernier lui laisse le choix entre s'en aller avec ses coéquipiers ou résister, car il a mentalement pris le contrôle, grâce à la Grâce, de tous les alliés du joueur rencontrés au cours du jeu et qui ont en otage ses coéquipiers, il termine ensuite en disant que "Dieu le regarde". Si le joueur décide de résister, le joueur combattra Joseph tout en libérant ses alliés de son emprise dans une sorte d'hallucination durant une tempête, provoqué par Joseph en renversant deux barils de Grâce. Le joueur finit par vaincre Joseph qui se fait arrêter par le Shérif, Joseph demande à Dieu de lui pardonner ainsi qu'à ses alliés car ils ne savent pas ce qu'ils font, selon lui, et récite un verset de sa composition. Lorsqu'il finit, une explosion nucléaire apparaît et enflamme la région, le joueur et ses coéquipiers montent dans une voiture et essaient de rejoindre le bunker de Dutch. La voiture fait un carambolage et tous les coéquipiers du joueur meurent, ce dernier est sauvé par Joseph qui l’amène dans le bunker. Lorsque le joueur se réveille, il découvre que Joseph a éliminé Dutch, et qu'il est menotté à la couchette, comme au début du jeu. On peut alors faire des parallèles entre la situation du début et celle de la fin, Joseph remplaçant Dutch. Joseph - qui commence sa phrase exactement par les mots de Dutch - lui dit alors que les politiciens se sont tus, les entreprises démantelés et que le monde a été "purifié par le feu divin" (ce qui veut, entre autres, dire que le monde est entré dans une guerre nucléaire) mais insiste que, par-dessus tout, cela signifiait qu'il avait raison. Il avait attendu cette "prophétie de Dieu" et préparé sa famille à ça et qu'il devrait le tuer pour les lui avoir enlevé, mais qu'il est tout ce qu'il lui reste. Il termine en disant au joueur qu'il est son Père et lui son enfant et qu'ils marcheront vers la lumière lorsque le monde sera prêt à renaître. Le jeu se termine à ce moment-là et les crédits apparaissent. L'explosion nucléaire de cette fin sert de toile de fond dans le standalone Far Cry: New Dawn, ce qui implique que cette fin est la fin officielle du jeu.
Fin : s'en aller
Pour cette fin, si le joueur choisit d'accepter la proposition de Joseph de s'en aller avec ses coéquipiers, le joueur et ses coéquipiers partent dans une voiture en laissant leurs alliés toujours sous l’emprise de Joseph. Alors que le Shérif dit qu'ils reviendront pour Joseph, il allume la radio, qui émet la musique"Only You", qui a un effet de conditionnement sur le joueur, comme Jacob, le grand frère de Joseph, l'avait fait pour lui, le jeu s’arrête lorsque le Shérif demande au joueur s'il va bien et le jeu se termine en laissant le doute au spectateur de la suite. Bien que considérée comme la bonne fin, elle est néanmoins à relativiser dans les critères qui font justement d'elle une bonne fin. Finalement, le standalone Far Cry New Dawn révèle que cette fin n'est pas celle officielle du jeu.
Note : il est important de noter que dans tous les cas, Joseph, l'antagoniste principal, gagne toujours sous une certaine perspective, une première dans la franchise .
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